CR400AF 和 CR400BF 的適用線路有一定區別，但總體來說技術參數相對一致，保障了線路、站臺、檢修廠房、檢修設備等均可相互共用。

CR400AF 和 CR400BF 根據線路適用性、客戶定制化需求及部分功能的加裝升級等，衍生出了多種子系列車型。

CR400AF 系列，如 CR400AF-A 為 16 輛編組，是主力車型；CR400AF-B 增加了一節二等座車，為 17 輛超長編組型；CR400AF-C 為京雄城際鐵路設計，采用全新外型和智能化自動駕駛；CR400AF-G 為高寒抗風沙車型，增加獨立司機室門；CR400AF-Z 車頭采用低阻力流線型，車體外觀優化，客艙服務升級，CR400AF-BZ 是其 17 輛編組版本。

CR400BF 系列，CR400BF-A 是 16 節長編組，采用 8M8T 動力配置；CR400BF-B 比 CR400BF-A 增加一節二等座車廂，采用 8M9T 動力配置；CR400BF-C 為京張鐵路及冬奧會設計，可耐高寒及抗風沙；CR400BF-G 是 8 節高寒型，運營于東北地區及相關線路；CR400BF-Z 于 2021 年投入京廣鐵路運營，CR400BF-BZ 是 17 輛編組版本，CR400BF-GZ 為 8 節高寒型智能動車組，運營于京哈高鐵。

CR400AF 主要運行線路有京滬高鐵、京津城際等，CR400BF 也在多個線路運營。兩種車型在制造技術方面堅持軟硬件自主創新研發，建立了中國高速動車組標準技術平臺，在多項性能指標方面取得了技術創新和突破。