飛度不同排量版本保養成本有一定差異。

首先在保險方面，飛度無限 MUGEN 版車價相對較高，首年保費約 5000 元，三年保險費用總成本約 12500 元，平均一年約 4167 元，比次低配潮享版貴一些。

在保養上，飛度無限 MUGEN 版搭載 1.5L 自然吸氣發動機，以次低配潮享版保養周期和價格為參考，首保 5000km 免費，之后保養間隔 5000km，小保養費用 454 元，20000km 保養花費 649 元，40000km 保養 1202 元。三年行駛 60000km 保養總費用約 6382 元，平均一年 2127 元，每月 177 元。普通版飛度保養成本也類似，機油、機濾等是保養主要花費。

在油耗方面，飛度無限 MUGEN 版 NEDC 綜合油耗 5.6L/100km，普通版 5.3L/100km。按每年 20000km 里程、92 號汽油 9.01 元/L 計算，無限 MUGEN 版一年燃油費約 10091 元，三年約 30273 元，平均每月 840 元；普通版三年油費約 28651 元，平均每月 795 元，每月能省至少 45 元。

總體來說，飛度不同排量版本保養成本差異主要在購車成本、后期油耗方面。飛度保養流程和價格相對合理，每次保養加注燃油添加劑，保養成本不算高，值得選擇。