摩托車風冷和水冷的區別有：大小區別、占用空間區別、價格區別、配置區別、散熱方式區別、特點區別。

大小區別：風冷發動機的結構比較簡單，體積也比較小，隱藏性更好一些，而水冷發動機的結構比較復雜，體積也比較大，一般在摩托車的側面和前面很容易看到。

占用空間區別：風冷發動機占用空間比較小，而水冷發動機占用的空間比較大。

價格區別：風冷發動機的價格要比水冷發動機的價格更低。

配置區別：風冷發動機的缸筒內會裝有非常多的散熱片，在缸頭內也會設有風道，而水冷發動機的基本配件是水泵。

散熱方式區別：風冷發動機是利用摩托車在行駛過程中的空氣流通來進行散熱的，這種散熱方式存在一個弊端，摩托車不能長時間處于高速行駛狀態，否則很容易損傷發動機，而水冷發動機是通過流動的水包裹缸套和缸頭來散熱，摩托車可以長時間處于高速行駛狀態。

特點區別：風冷發動機的特點是散熱系統可以達到零故障自然冷卻，而水冷發動機的特點是即便摩托車處于高速行駛狀態也能給車輛進行有效地降溫，在溫度低的時候，水冷發動機可以自動關閉節流閥。